La información cartográfica de los hábitats marinos es imprescindible para la aplicación de las Directivas y para la elaboración y actualización del Inventario Español de Hábitats y Especies Marinos. La información sobre los límites de distribución de las especies supone el nivel de conocimiento básico para un hábitat o especie, aplicable a numerosos estudios de la biología y ecología como diseño de experimentos científicos, modelización estadística del efecto del cambio climático, cuantificación de servicios ecosistémicos, programas de seguimiento, evaluación de impacto ambiental, análisis de presiones, planes de gestión de áreas marinas protegidas y procesos de decisión relacionados con la gestión costera.

Por ello, el objetivo general de CARTOMAR es mejorar el conocimiento sobre la biodiversidad marina en el norte de la Península Ibérica, necesario para la gestión de la zona litoral, mediante la recopilación de datos históricos de especies bentónicas de flora y fauna. El resultado generado en el proyecto (bases de datos y cartografías disponibles on line) supondrá una útil herramienta de trabajo en todos los ámbitos de la gestión e investigación de la biodiversidad y los recursos marinos para el hábitat 1170 (Arrecifes) de la Directiva Hábitats (92/43/CEE).